2019年9月20日,Blood Science官网刊登了题为Epigenetic regulation of hematopoietic stem cell homeostasis的文章,通讯作者为浙江大学医学院钱鹏旭研究员,共同第一作者为姜蓬垒、王辉、郑嘉宸。
郑嘉宸为浙江大学爱丁堡大学联合学院2017级本科生。
文章网址:
https://journals.lww.com/bls/Fulltext/2019/08000/Epigenetic_regulation_of_hematopoietic_stem_cell.5.aspx
文章大意
本篇Review主要围绕造血干细胞稳态的表观调控机制来展开的,很幸运的发表在中国第一本血液学专业杂志《Blood Science》的创刊号上。白血病作为世界卫生组织公布的十大恶性疾病之一,一直都是热门的研究主题。而造血干细胞(HSCs)作为血液系统的基石,它的突变会导致白血病等疾病的发生。干细胞的平衡主要由自我更新和多能分化两个过程来维持,如果造血干细胞过度增殖就会造成严重的白血病,而另一方面如果造血干细胞过度分化不仅会直接导致人体内缺乏造血干细胞,也会间接导致诸如免疫细胞、红细胞等功能细胞的匮乏,造成贫血等疾病(Figure.1)。因此如果能揭示造血干细胞稳态的调控机制,将会对白血病的治疗产生非常积极的影响。
造血干细胞稳态的调控因子基本上可以分为遗传因子和表观遗传因子两类。随着技术的发展,表观遗传因子的重要性也越来越为研究者们所关注,但表观遗传方面的研究相对于遗传研究还是有很多亟待探索的空间。表观遗传因子则又可以细分为DNA甲基化,组蛋白修饰,染色质重构,非编码RNA,RNA修饰等方面,而这也是本文的主要讨论部分。同时我们也可以看到研究造血干细胞的表观调控机制在造血干细胞的扩增、造血相关疾病的治疗等应用方面都有着很大的潜力(Figure.2)。
这篇Review是郑嘉宸同学今年暑假在钱鹏旭研究员的指导下,和姜蓬垒、王辉两位博士后师兄一起完成的。作为本科生,自认为对本领域的了解和认识比较粗浅,尤其是在表观遗传学方面掌握的知识还不够深入,所以他更多地关注造血干细胞的背景介绍和干细胞稳态这两方面,而调控机制部分由两位博士后师兄完成。
此外嘉宸同学也负责了abstract, introduction,editing和作图这些部分的工作。Abstract和introduction主要是基于所有部分和文章背景来写的,editing则是在文章初步成稿之后修改部分词汇句型的用法和纠正语法错误。
至于作图,他还自己摸索了一下Adobe Illustrator的用法,然后根据文章最后的概述和背景介绍制作了两幅简图。通过这篇综述文章的撰写,嘉宸同学说,自己对造血干细胞和表观遗传学有了进一步的认识,也在此过程中学习和收获了一些新的技能。
关于暑期科研,郑嘉宸很努力也很认真,越努力越幸运,越认真越精彩。
他积极利用假期,分别申请了浙江大学医学院和爱丁堡大学的实验室科研训练,两校双城实习,他珍惜这样的经历,不错过任何学习的机会。
No.1
浙大医学院科研经历
和大多数ZJE同学一样想多积累一点实验室科研经验,大一暑假的时候我就申请了实验室实习。由于我对于干细胞领域比较感兴趣,也正好当时欧阳院长告诉我们ZJE的任课老师浙江大学医学院钱鹏旭的实验室接收暑期实习学生,所以我就加入了Qian Lab这个大家庭。当时实验室成立不久,初期实验室人员不多,也就给了我们本科生更多的机会向老师们和师姐们学习请教,师姐让我印象很深的一句话是“要学的不只是实验操作,而是每个步骤背后的原理”。
大一暑假的时候我们做的实验比较基础,主要是学习了一些基本技术,比如质粒抽提转化、western blot、PCR。之后在大二寒假,钱老师给了我们一个关于H19基因的小课题,这时候我们就接触到了qPCR等技术,同时也学习了小鼠成纤维细胞(MEF)的培养及传代的技术。在刚过去的暑假里,我们在进行SRTP项目的过程中也学习了组织RNA提取,单核细胞抽取等基本技术。也就在大二寒假,很感谢钱老师对于我们ZJE本科生英语能力和文献阅读总结能力的信任,他让我和孙翔同学(2017级)在印记基因和干细胞相关方面多阅读收集文献,尝试了一下review的写作,这个任务也是一直延续到了现在,在这个过程中我也继续锻炼了自己的作图能力,由于已经做好的图尚在整理投稿阶段,在此我制作了一个简图大致介绍一下我和孙翔同学的工作。在这篇综述中,我们系统性的介绍了印记基因在不同类型干细胞中的功能与调控机制,还探讨了印记基因的突变导致疾病发生的原理,并进一步展望了如何利用印记基因来对疾病进行诊断和治疗。
No.2
爱丁堡大学科研训练
我希望能接触不同的生物方向,感受不同国家科研模式的差异也非常有意义,所以在今年暑假我也利用了五周时间去爱丁堡大学在Gedi(ZJE的任课老师)的实验室里参与了他的project。Gedi的研究方向主要是行为神经学,我和朱海宇新同学(2017级)所参加的项目是schema-based learning和与媒体相关的MyNewsScan, 我们所做的实验基本上是干实验,也就是用电脑及眼球追踪、面部表情捕捉等仪器来获取被试者在进行实验时的各种参数。当然我还是做了两次湿实验,用ELISA技术来测量被试者唾液样品中的皮质醇在不同阶段的浓度。
在实验之外,实验室的氛围和作息也比较自由,Gedi还带着我们四个ZJE暑研的同学一起去体验了一次他最爱的高尔夫。这段暑研经历让我觉得我们BMS专业的同学和生信乃至是CS专业的同学可以很好地交叉互补,共同完成一个项目,而且海外暑研非常锻炼自己的独立生活能力,也算是为未来的留学生活做了准备。
最后,钱老师很欢迎大一大二的学弟学妹们来申请实验室实习,欢迎大家咨询我或者通过邮箱直接联系老师啦。
实验室主页:
https://person.zju.edu.cn/pengxuqian
钱鹏旭老师邮箱:axu@zju.edu.cn