【Biomed-X Seminar第122期】西湖大学王寿文教授分享单细胞谱系追踪技术

2024年12月10日下午，浙江大学爱丁堡大学联合学院Biomed-X Seminar第122期在国际校区2A楼A203报告厅顺利开展。受学院刘琬璐研究员邀请，西湖大学王寿文教授作“High-resolution, noninvasive single-cell lineage tracing in mice and humans based on DNA methylation epimutations”的学术报告。

王教授致力于开发单细胞谱系追踪数据的分析方法，并结合转录组与表观遗传组，进一步理解细胞分化与胚胎发育的基本规律。体内谱系追踪在揭示组织发育和体内平衡的基本原理方面具有巨大的潜力。然而，目前人类的谱系追踪依赖于极其罕见的体细胞突变，其时间分辨率和谱系准确性有限。王教授介绍了最近他们团队开发了一款基于DNA甲基化频繁表观突变的通用谱系追踪工具，由他们的新计算方法MethylTree实现。使用具有已知谱系和表型标记的单细胞全基因组DNA甲基化数据集，MethylTree以接近100%的准确度重建了不同细胞类型、发育阶段和物种的谱系历史。他们在小鼠和人类血液中展示了基于表观突变的单细胞多组学谱系追踪，MethylTree再现了造血中的分化层次。将MethylTree应用于人类胚胎，他们揭示了四细胞期的早期命运承诺。在天然小鼠血液中，鉴定了约250个造血干细胞克隆。MethylTree为人类及其他领域的高分辨率、非侵入性和多组学谱系追踪打开了大门。